Thông tư 139/2025/TT-BTC do Bộ Tài chính ban hành quy định lộ trình sắp xếp lại thị trường giao dịch cổ phiếu. Chậm nhất đến ngày 31/12/2026, toàn bộ cổ phiếu niêm yết trên HNX phải được chuyển sang HoSE. Sau thời hạn này, HNX sẽ không tiếp nhận hồ sơ đăng ký giao dịch cổ phiếu mới. Thực tế, việc niêm yết mới tại HNX đã ngừng theo Thông tư 57/2021/TT-BTC ban hành năm 2021.
Trong mô hình mới, HoSE sẽ tập trung toàn bộ cổ phiếu, chứng chỉ quỹ và chứng quyền có bảo đảm, trong khi HNX sẽ đảm nhiệm vai trò là sở giao dịch chuyên biệt đối với trái phiếu và phái sinh. HNX cũng sẽ mở rộng vai trò với các cấu phần mới như thị trường carbon và sàn vốn dành cho doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo. Theo định hướng, HNX sẽ phối hợp với VNX để nghiên cứu và đưa vào giao dịch các sản phẩm mới, gồm hợp đồng quyền chọn và phái sinh trên nhiều loại tài sản, kể cả chỉ số giá vàng.
Tính đến cuối tháng 5/2026, HNX có khoảng 299 mã cổ phiếu niêm yết với hơn 19,4 tỷ cổ phiếu lưu hành, và 824 mã cổ phiếu đăng ký trên UPCoM với >46,4 tỷ cổphiếu. Giá trị vốn hóa của thị trường cổ phiếu niêm yết trên HNX ước đạt 479.000 tỷ đồng. Trong khi đó, HOSE có 655 mã chứng khoán niêm yết, bao gồm 403 cổ phiếu, 18 mã chứng chỉ quỹ ETF và 230 chứng quyền có bảo đảm với tổng khối lượng niêm yết trên 217,92 tỷ đơn vị. Giá trị vốn hóa HOSE đạt khoảng 8,78 triệu tỷ đồng, tăng 5,68% so với cuối năm 2025, chiếm hơn 94,83% tổng vốn hóa cổ phiếu niêm yết toàn thị trường.
HoSE được kỳ vọng đóng vai trò là trung tâm giao dịch cổ phiếu, còn HNX chuyên về trái phiếu, phái sinh và các thị trường mới. Việc phân bảng cổ phiếu theo vốn hóa và chất lượng quản trị được nghiên cứu nhằm nâng cao hiệu quả quản lý và thu hút vốn đầu tư nước ngoài. HoSE đang triển khai hệ thống công nghệ KRX có khả năng hỗ trợ tối đa khoảng 2.000 mã và đang xem xét nâng cấp để đáp ứng nhu cầu tăng trưởng giao dịch.
Việc tập trung hóa chức năng dự kiến thúc đẩy sự hình thành một thị trường chứng khoán chuyên nghiệp, minh bạch và an toàn, qua đó tạo nền tảng huy động vốn trung và dài hạn cho nền kinh tế. Các cơ quan quản lý kỳ vọng sự hợp nhất này sẽ khắc phục nút thắt về hạ tầng và hệ thống giao dịch, đồng thời tăng cường quản trị và công bố thông tin trên HoSE. Khi mô hình tổ chức hoàn thiện, HoSE sẽ là trung tâm giao dịch, còn HNX sẽ chuyên về trái phiếu và phái sinh, phù hợp với chuẩn mực quốc tế và kỳ vọng nâng hạng thị trường.